最近的工作表明，在Covid-19筛选中使用音频数据的可能性。然而，对监测疾病进展进行了很少的探索，特别是通过音频在Covid-19中恢复。跟踪疾病进展特征和复苏模式可能导致巨大的见解和更及时的治疗或治疗调整，以及在医疗保健系统中更好的资源管理。本研究的主要目的是利用顺序深度学习技术探讨Covid-19监测的纵向音频动力学的潜力，专注于疾病进展预测，特别是恢复趋势预测。我们分析了5天至385天的212个个体中众包呼吸系统数据，以及其自我报告的Covid-19测试结果。我们首先探讨捕获音频生物标志物的纵向动态的好处，用于Covid-19检测。强化性能，产生0.79的AUC-ROC，灵敏度为0.75，特异性为0.70，与不利用纵向动态的方法相比，该方法的有效性。我们进一步检查了预测的疾病进展轨迹，其显示出高一致性与纵向试验结果，测试队列中的0.76中的相关性，测试队列的子集中为0.86，其中12名参与者报告疾病恢复。我们的研究结果表明，通过纵向音频数据监测Covid-19进展在追踪个人疾病进展和恢复方面具有巨大潜力。
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生物关键是一种信号，可以从人体中连续测量，例如呼吸声，心脏活动（ECG），脑波（EEG）等，基于该信号，机器学习模型已经为自动疾病的非常有前途的性能开发检测和健康状态监测。但是，DataSet Shift，即，推理的数据分布因训练的分布而异，对于真实的基于生物信号的应用程序并不罕见。为了提高稳健性，具有不确定性资格的概率模型适于捕获预测的可靠性。然而，评估估计不确定性的质量仍然是一个挑战。在这项工作中，我们提出了一个框架来评估估计不确定性在捕获不同类型的生物数据集转换时估计的不确定性的能力。特别是，我们使用基于呼吸声和心电图信号的三个分类任务，以基准五个代表性的不确定性资格方法。广泛的实验表明，尽管集合和贝叶斯模型可以在数据集移位下提供相对更好的不确定性估计，但所有测试模型都无法满足可靠的预测和模型校准中的承诺。我们的工作为任何新开发的生物宣布分类器进行了全面评估，为全面评估铺平了道路。
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收集大量人生成的健康数据（可穿戴性），但注释给机器学习模型的注释过程是不切实际的。本文讨论了使用以前应用于视觉域的自我监督损失的自我监督方法，例如以前应用于视觉域，可以应用于跨越睡眠，心脏和心脏的下游分类任务的高维健康信号。代谢条件。为此，我们适应数据增强步骤和整体架构，以满足数据（可穿戴迹线）的时间性，并通过比较其他最先进的方法（包括监督学习）和对抗的无监督来评估5个下游任务。代表学习方法。我们表明SIMCLR在大多数下游评估任务中表明了对抗性方法和完全监督的方法，并且所有自我监督方法都优于完全监督的方法。这项工作为应用于可穿戴时间级域的对比方法提供了全面的基准，显示了下游临床结果的任务不可知论见的承诺。
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持续的学习方法通过试图解决灾难性遗忘来帮助深度神经网络模型适应和逐步学习。但是，无论这些现有方法是否传统上应用于基于图像的任务，都具有与移动或嵌入式传感系统生成的顺序时间序列数据相同的疗效仍然是一个未解决的问题。为了解决这一空白，我们进行了第一项全面的经验研究，该研究量化了三个主要的持续学习方案的性能（即，在三个移动和嵌入式感应应用程序中的六个数据集中的三个主要的持续学习方案（即正规化，重播和重播）的性能。不同的学习复杂性。更具体地说，我们在Edge设备上实现了端到端连续学习框架。然后，我们研究了不同持续学习方法的性能，存储，计算成本和记忆足迹之间的普遍性，权衡。我们的发现表明，以示例性计划（例如ICARL）重播，即使在复杂的场景中，甚至在复杂的场景中都具有最佳的性能权衡，以牺牲一些存储空间（少数MB）来训练示例（1％至5％）。我们还首次证明，以有限的记忆预算进行连续学习，可行和实用。特别是，两种类型的移动设备和嵌入式设备的延迟表明，可以接受递增的学习时间（几秒钟-4分钟）和培训时间（1-75分钟），可以接受，因为嵌入式嵌入式时可能会在设备上进行培训设备正在充电，从而确保完整的数据隐私。最后，我们为希望将不断学习范式应用于移动传感任务的从业者提供了一些准则。
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A generalized understanding of protein dynamics is an unsolved scientific problem, the solution of which is critical to the interpretation of the structure-function relationships that govern essential biological processes. Here, we approach this problem by constructing coarse-grained molecular potentials based on artificial neural networks and grounded in statistical mechanics. For training, we build a unique dataset of unbiased all-atom molecular dynamics simulations of approximately 9 ms for twelve different proteins with multiple secondary structure arrangements. The coarse-grained models are capable of accelerating the dynamics by more than three orders of magnitude while preserving the thermodynamics of the systems. Coarse-grained simulations identify relevant structural states in the ensemble with comparable energetics to the all-atom systems. Furthermore, we show that a single coarse-grained potential can integrate all twelve proteins and can capture experimental structural features of mutated proteins. These results indicate that machine learning coarse-grained potentials could provide a feasible approach to simulate and understand protein dynamics.
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2022-11-24
The 1$^{\text{st}}$ Workshop on Maritime Computer Vision (MaCVi) 2023 focused on maritime computer vision for Unmanned Aerial Vehicles (UAV) and Unmanned Surface Vehicle (USV), and organized several subchallenges in this domain: (i) UAV-based Maritime Object Detection, (ii) UAV-based Maritime Object Tracking, (iii) USV-based Maritime Obstacle Segmentation and (iv) USV-based Maritime Obstacle Detection. The subchallenges were based on the SeaDronesSee and MODS benchmarks. This report summarizes the main findings of the individual subchallenges and introduces a new benchmark, called SeaDronesSee Object Detection v2, which extends the previous benchmark by including more classes and footage. We provide statistical and qualitative analyses, and assess trends in the best-performing methodologies of over 130 submissions. The methods are summarized in the appendix. The datasets, evaluation code and the leaderboard are publicly available at https://seadronessee.cs.uni-tuebingen.de/macvi.
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Counterfactual Explanations are becoming a de-facto standard in post-hoc interpretable machine learning. For a given classifier and an instance classified in an undesired class, its counterfactual explanation corresponds to small perturbations of that instance that allows changing the classification outcome. This work aims to leverage Counterfactual Explanations to detect the important decision boundaries of a pre-trained black-box model. This information is used to build a supervised discretization of the features in the dataset with a tunable granularity. Using the discretized dataset, a smaller, therefore more interpretable Decision Tree can be trained, which, in addition, enhances the stability and robustness of the baseline Decision Tree. Numerical results on real-world datasets show the effectiveness of the approach in terms of accuracy and sparsity compared to the baseline Decision Tree.
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We introduce a new benchmark dataset, Placenta, for node classification in an underexplored domain: predicting microanatomical tissue structures from cell graphs in placenta histology whole slide images. This problem is uniquely challenging for graph learning for a few reasons. Cell graphs are large (>1 million nodes per image), node features are varied (64-dimensions of 11 types of cells), class labels are imbalanced (9 classes ranging from 0.21% of the data to 40.0%), and cellular communities cluster into heterogeneously distributed tissues of widely varying sizes (from 11 nodes to 44,671 nodes for a single structure). Here, we release a dataset consisting of two cell graphs from two placenta histology images totalling 2,395,747 nodes, 799,745 of which have ground truth labels. We present inductive benchmark results for 7 scalable models and show how the unique qualities of cell graphs can help drive the development of novel graph neural network architectures.
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全球越来越多的大学将各种形式的在线学习和混合学习作为其学术课程的一部分。此外，由于199年大流行而造成的最新变化导致在线教育的重要性和无处不在。电子学习的主要优点之一不仅是改善学生的学习经验并扩大教育前景，而且还可以通过学习分析来洞悉学生的学习过程。这项研究有助于通过以下方式改善和理解电子学习过程的主题。首先，我们证明可以根据从学生的行为数据中得出的顺序模式来构建准确的预测模型，这些模式能够在课程的早期识别出表现不佳的学生。其次，我们通过研究是否应根据特定于课程的顺序模式或基于更一般的行为模式的几个课程来构建每个课程的预测模型，从而调查了建立此类预测模型的特异性征用性权衡。最后，我们提出了一种捕获行为数据中时间方面的方法，并分析了其对模型预测性能的影响。我们改进的序列分类技术的结果能够以高度准确性来预测学生的表现，而对于课程特异性模型的结果达到了90％。
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卷积神经网络（CNN）在各种应用域中达到高精度，但需要大量的计算和产生昂贵的数据移动。在交易准确性时降低这些成本的一种方法是体重和/或激活单词长度的减少。因此，层的混合精液量化可以在充气设计空间时产生更有效的结果。在这项工作中，我们提出了一种深入的定量方法，以考虑给定FPGA的硬件资源有限的硬件资源，以有效地探索设计空间。我们的整体探索方法从架构到逻辑级别垂直穿越各种设计入门级别，并横向涵盖从处理元素到数据流的优化，以获得有效的混合过度CNN加速器。我们由此产生的硬件加速器实施了真正的混合精确操作，从而有效地执行了层和频道量化的CNN。映射进料和身份转换连接混合精液CNNS导致竞争精度 - 触及折衷方案：245帧/s，RESNET-18的最高率为87.48％，resNet-18的前5位准确性和92.9％的前5位准确性，1.13 TOPS/TOPS/TOPS/TOPS/TOPS/ S分别用于Resnet-152。因此，与各自的浮点基线相比，参数所需的内存足迹减少了4.9倍和9.4倍。
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